Microarreglo
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Microarreglos. El término micro limita estos arreglos a un tamaño muy pequeño, existiendo también los Macroarreglos, los cuales admiten un número menor de muestras.
Sumario
Origen
Los microarreglos está intimamente ligados al desarrollo y miniaturización de las técnicas de afinidad que se conocen y que se han empleado desde hace años como una herramienta común en biología molecular. Los primeros ensayos de afinidad con muestras fijas sobre soportes sólidos se realizaron con ensayos inmunológicos inmovilizando sobre una superficie antígenos o anticuerpos para su detección.
Después se comenzaron a emplear filtros de nitrocelulosa para que actuasen como soporte sólido para la adhesión de moléculas de DNA. De esta forma, el DNA adherido no interaccionaba con las otras moléculas inmovilizadas pero mantenía su capacidad de hibridar con moléculas complementarias presentes en solución.
La detección de estas hibridaciones se realizaba mediante la detección de un marcador radiactivo en un revelado por autorradiografía. A este tipo de técnica se le bautizó con el nombre de Southern blot. Este principio después se extendió al campo de la inmovilización de proteínas (Western blot) y de RNA (Northern blot).
Muestras
Las muestras a analizar pueden ser ADN, proteínas u oligonucleótidos. Los más abundantes son los microarreglos de ADN. Un chip de ADN que contiene todo el genoma humano, aproximadamente 30000 genes, puede ser del tamaño de un sello postal.
Uso
El trabajo con microarreglos permite estudiar el comportamiento y/o la presencia de genes y proteínas en muestras biológicas. Se puede conocer el mecanismo molecular mediante el cual actúa un fármaco o medicamento determinado, si se conocen los genes que varían su expresión al estudiar las células o el organismo antes y después de la aplicación del fármaco.
Igualmente se puede predecir si un organismo vivo responderá positiva o negativamente ante un tratamiento, estudiando el comportamiento de genes marcadores de respuesta.
El diagnóstico de enfermedades es también uno de los usos de los microarreglos y macroarreglos en general. Este diagnóstico, al igual que los otros usos, debe ser corroborado empleando otra técnica molecular o clínica.
Fuentes de variabilidad en un experimento de microarreglos
- Variabilidad biológica. Esta es intrínseca a todos los organismos, pueden estar influida por factores tanto genéticos como ambientales.
- Variabilidad técnica. Esta se puede introducir durante la extracción, marcado o hibridación de las muestras.
- Error de medición. Esta asociada a la lectura del microarreglo, la cual puede afectarse por ejemplo, por la presencia de polvo en la laminilla.
